福建省福清第三中学发轫于清代光绪十八年(1892年)牧师方鲍参创建的福清培元书院。其后，学校曾先后易名为融美中学堂、私立融美初级中学。1952年11月28日人民政府接办学校，又历经福清第二初级中学、福清第三中学、福清龙田中学的传承演变，1986年5月定名为福清第三中学。改革开放以来，学校快速发展，成为福清市培育人才的一个摇篮而享誉于海内外。

2015年11月，福建省教育厅发布闽教基〔2015〕44号文件，确认福清第三中学高中部为“福建省一级达标高中”。成为福清市继福清一中、福清华侨中学、福清二中后第四所“福建省一级达标高中”学校。

镶嵌在龙高半岛福清湾突出部的一颗璀璨明珠--龙田镇，是福建省的一个沿海大集镇。福清第三中学就坐落于这个镇的东北端。120年来，学校与祖国共沉浮，同命运，走过艰难而曲折的道路，历经创始、发展、新生、昌盛、挫折、恢复、腾飞七个阶段。